在凝膠電泳儀中，DNA或蛋白質(zhì)樣品的分離（通?；诖笮。┦峭ㄟ^(guò)施加電場(chǎng)使它們遷移通過(guò)凝膠來(lái)分離的。凝膠電泳在生物醫學(xué)研究實(shí)驗室中是常規操作，可用于回答各種不同的問(wèn)題，因此，實(shí)際上并沒(méi)有一種通用的方法來(lái)分析結果。
例如，諸如蛋白質(zhì)印跡，RNA印跡和DNA印跡的不同技術(shù)都涉及凝膠電泳。
如果您要進(jìn)行DNA樣品的瓊脂糖凝膠電泳（常見(jiàn)的一種方法），通常需要至少做兩件事：1）區分未切割的質(zhì)粒與插入片段，帶切口的質(zhì)粒和切割的質(zhì)粒，以及2）估計使用標準曲線(xiàn)Excel或計算器計算各種DNA片段的大小。
運作方式如下。
檢查您的實(shí)驗室筆記本以確定哪些樣品已裝入哪些通道。當裝載凝膠孔時(shí)，您應該注意每個(gè)泳道/樣品的身份。
確定哪個(gè)泳道包含DNA標準的“階梯”。這些是已知長(cháng)度的片段。它們的遷移距離可用于通過(guò)標準曲線(xiàn)Excel或其他計算器確定樣品片段的大小。
用尺子測量從孔到跟蹤染料的圖像距離，該染料比任何DNA條帶都行進(jìn)的距離遠（換句話(huà)說(shuō)，它將位于凝膠的底部）。記錄此數字-您使用的單位并不重要。
測量照片上從孔到“階梯”中每個(gè)帶的距離，然后用該距離除以跟蹤染料帶所經(jīng)過(guò)的距離。此計算為您提供每個(gè)頻段的相對遷移率。
示例：假設跟蹤染料帶移動(dòng)了6英寸，而我們有三個(gè)帶移動(dòng)了5、4.5和3.5英寸。
他們的相對流動(dòng)性是什么？答：我們將5、4.5和3.5除以6得到的相對遷移率分別為0.833、0.75和0.5833。
將相對遷移率輸入到電子表格程序（Excel或您使用的任何其他類(lèi)似程序）中，并將階梯中每個(gè)片段的大?。ㄒ郧A基為單位）一起輸入。
制造商會(huì )為您提供他們提供的梯子中每個(gè)碎片的大小，因此您應該已經(jīng)有了此信息。
在x上繪制具有相對移動(dòng)性的數據，在y上繪制以千為單位的大小的數據。
在電子表格程序上使用趨勢線(xiàn)函數將方程擬合到數據中。該方程式應為冪方程式（例如x ^ -2），并且應相對較好地擬合數據（R系數至少為0.9）。這將創(chuàng )建一條曲線(xiàn)和一個(gè)標準曲線(xiàn)Excel。
查看與您的樣本相對應的譜帶。
請記住，較小的DNA片段比較大的DNA片段穿過(guò)凝膠的距離更遠，因此靠近跟蹤染料的片段將小。但是請注意，如果未切割質(zhì)粒（環(huán)狀）DNA，它將像電話(huà)線(xiàn)一樣“超螺旋”或扭曲，這實(shí)際上會(huì )使它比相同大小的線(xiàn)性DNA 傳播得更遠。
同樣，未*切割的“切口”質(zhì)粒將比相同大小的線(xiàn)性DNA 傳播更短的距離。因此，您無(wú)法從凝膠中估計未切割質(zhì)粒的大小。
將每個(gè)泳道中的條帶與您在該泳道中加載的樣品的標識相匹配，并確定您所看到的是否是您所期望的。這將取決于實(shí)驗的性質(zhì)。
但是，一般來(lái)說(shuō)，如果您用兩種限制性酶消化插入質(zhì)粒，則可以預期該插入物中將沒(méi)有質(zhì)粒。
由于它比質(zhì)粒小得多，您可能會(huì )在該泳道中看到兩條帶，一條靠近頂部，而另一條靠近底部。僅用一種限制酶切割的質(zhì)粒應僅形成一條條帶，該條帶比用兩種限制酶切割的質(zhì)粒行進(jìn)的距離要遠一些，但不能遠至插入片段。
測量從孔到切出的質(zhì)粒的距離，并用尺子插入條帶。將這些數字除以跟蹤染料的行進(jìn)距離，即可得出插入片段和切割質(zhì)粒的相對遷移率。
將插入片段和剪切質(zhì)粒的相對遷移率插入電子表格程序為您計算的方程式中。這種計算應給您估計這些質(zhì)粒的大小。
